Modele anatomiczne czaszki odgrywają ważną funkcję w edukacji medycznej, badaniach naukowych również w praktyce medycznej. Ich znaczenie wynika z konieczności dokładnego poznania budowy czaszki, jaka jest jednym spośród wysoce złożonych elementów ludzkiego szkieletu. Modele anatomiczne pozwalają one na określone przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych zależności między poszczególnymi elementami czaszki również na łatwiejsze zrozumienie mechanizmów urazów, deformacji i patologii. Modele anatomiczne czaszki są również szeroko używane w stomatologii. Budowa czaszki ma niebagatelne znaczenie w ocenie i pomaganiu schorzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w ocenie struktury żuchwy i szczęki, co pozwala precyzyjne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są również modele anatomiczne czaszki w medycynie sądowej i antropologii. Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem szczegółowości oraz surowcem wytworzenia. Jednym spośród niezwykle charakterystycznych typów są standardowe modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające podstawowe kości oraz ich połączenia. Modele anatomiczne tego typu są często używane w edukacji również służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną odmianę stanowią modele anatomiczne czaszki z ruchomymi elementami, które gwarantują na łatwiejsze zrozumienie połączeń między kośćmi i procesów ich ruchu, co jest wyjątkowo pożądane w ortodoncji i chirurgii szczękowej. W znacznie zaawansowane modele anatomiczne czaszki mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co zezwala na dokładne zbadanie niektórych elementów. Dzięki temu wolno zobaczyć, w jaki sposób poszczególne kości są ze sobą połączone, jakie mają kształty i jakie struktury anatomiczne się na nich znajdują. Tego typu modele anatomiczne są niezwykle pomocne w nauce anatomii i chirurgii, ponieważ umożliwiają wnikliwą analizę struktur trudnych do zarejestrowania w rzeczywistej czaszce.
Innym rodzajem są modele anatomiczne czaszki z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w nauce szczegółowej anatomii. W takich modelach drugie czynniki czaszki są zaznaczone barwami, co umożliwia ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę czaszki mogą być oznaczone innym odcieniem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób pomagający ich zapamiętanie. Jest to wyjątkowo odpowiednie dla studentów medycyny, którzy muszą opanować skomplikowaną terminologię anatomiczną. Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne czaszki z odzwierciedlonymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego typu modele anatomiczne mają przebieg nerwów czaszkowych i naczyń krwionośnych, co jest niezmiernie cenne w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim wolno prześledzić ścieżki rozwoju nerwów, ich umieszczenie względem struktur kostnych także miejsca, w jakich mogą być one uciskane lub uszkadzane. Nowa metoda umożliwia jednocześnie na kształtowanie projektów czaszki w technice druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być tworzone na podstawie konkretnych danych tomograficznych, co zezwala na odwzorowanie indywidualnych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są szczególnie pomocne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ umożliwiają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie czynności na określonym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Technika ta jest także stosowana w rekonstrukcji buzi w przypadkach urazów i deformacji wrodzonych.
